Найден Тодоров е роден през 1974 година в Пловдив, България. Първите си уроци по пиано получава на петгодишна възраст, а едва на 16 години прави диригентския си дебют. Голямо влияние върху формирането му като диригент са оказали Александър Владигеров в България и професор Карл Йостерайхер във Виена. Завършва с отличие музикалното училище „Добрин Петков“ в Пловдив и продължава обучението си по оркестрово дирижиране в легендарния клас на професор Урош Лайовиц, хорово дирижиране при професор Гюнтер Тойринг и оперно дирижиране при професор Конрад Лайтнер в Университета за музикално и сценично изкуство във Виена. През 1996 година е поканен от йерусалимската фондация „Ленард Бърнстейн“ в Академията Рубин в Йерусалим, където специализира при диригента на Израелската филхармония Менди Родан.
През 1997 година той създава в родния си град фестивала „Тракийско лято”. Година по-късно получава първия си постоянен международен ангажимент – в Хайфа, Израел, със Северно-израелския симфоничен оркестър, където е избран между повече от 150 кандидати за постоянен диригент на оркестъра.
В следващите години Найден Тодоров гостува на сцените на редица от най-големите културни центрове в Европа, Азия, Африка и Америка, записва за американски, европейски и израелски звукозаписни компании над 130 компакт диска.
През 2000 година, само на 26 години, е поканен за музикален директор на Пловдивската опера и филхармония, като се оказва най-младия диригент в България на такава позиция. В периода 2003-2005 г. работи като художествен ръководител на Оперно-филхармонично дружество Бургас. Няколко години по-късно заема тази позиция и в хор „Дунавски звуци“ в Русе. В периода 2005-2017 Найден Тодоров е директор на Държавната опера в Русе.
През 2013 година Найден Тодоров се дипломира като мениджър в областта на културата в Нов български университет, където през последните години е поканен да изнася лекции. От 2017 година е директор на Софийската филхармония, с която гостува на някои от най-престижните сцени в Европа – зала „Бозар“ – Брюксел, „Концертхаус“ и „Музикферайн“ – Виена, голямата зала на Берлинската филхармония, „Лидерхале“ - Щутгарт и др. През последните години води в България за концерти на ръководената от него Софийска филхармония едни от най-известните по света певци, диригенти и инструменталисти.
Найден Тодоров е работил с всички български държавни оркестри и оперни театри, както и с много оркестри и оперни театри в Европа, Азия, Северна и Южна Америка и Африка, между които се открояват Виенският симфоничен оркестър, Виенската народна опера, Берлинският симфоничен оркестър, Филхармонията на Богота - Колумбия, Националният оркестър на Бразилия, Филхармонията на Токио и мн. др.
През 2013 г. и 2019 г. е избран от слушателите на Българското национално радио за „Музикант на годината“. Няколко пъти получава за своята дейност и наградата „Кристална лира“. Носител е на наградата „Емил Чакъров“ през 2014 г. През 2015 г. му е присъдено званието „Почетен гражданин“ на град Русе. Удостоен е и с награди от Словашкия музикален фонд, „Ротари клуб“ – Виена, фондация „Борджезе“, наградата „София“ за постановката на операта „Фауст“ в Националната опера и балет, „Златно петолиние“ за принос към развитието на българската музика, „Златна книга“ за принос в развитието на българската култура, наградата на фондация „Джордж Уохтер“ – Швейцария и др. През 2020 г. става четвъртият носител на Наградата за хуманитаристика „Богдан Богданов“ на Нов български университет. Лауреат е в първото издание на кампанията „Българските посланици на културата“ на Българското национално радио през 2021. Заради майсторството му в създаването на международни музикални проекти и за изключителните му артистични успехи на сцените по света през есента на 2023 г. получава престижната италианска награда „Aquila d-Oro“.
От 2018 година Найден Тодоров става водещ на образователното предаване за класическа музика на Българската национална телевизия – „На концерт с БНТ 2“.
През 2021 г. издава първата си книга с разкази „Полъх от ангели“.
Найден Тодоров е носител на Ордена за културни заслуги с ранг „Велик офицер“ от Президента на Румъния (2025 г.), както и на едно от най-престижните френски отличия - ордена „Кавалер на изкуството и литературата“ (Chevalier de l-Ordre des Arts et des Lettres) – от Министерството на културата на Република Франция (2025 г. ).
В периодите февруари-юни 2023 година и 9 април 2024 - 16 януари 2025 е служебен министър на културата.
